1925年3月12日，一場基督徒式的葬禮在協和大禮堂舉行，這是早年是一名外科醫生后來成為革命家的孫中山的葬禮。孫中山生命最后兩個月的大部分時間，是在協和度過的。1924年的最后一天，孫中山抱病來到北京，連日來不斷加重的肝病，讓他都已無力宣讀那300字的“入京宣言”。此后，有人建議他到東郊民巷的德國醫院去，他說：“東郊民巷是租界，我不去。”并最終選擇了協和醫院。

　　1925年1月26日，孫中山入院，此時他已經不能進食，當日下午外科專家兼協和醫院代理院長劉瑞恒主刀為其進行剖腹探查術，確診為癌癥晚期。于2月17日發出病危通知書，最終于3月12日魂歸天國。現在的協和醫院還保留著一份13頁的報告，英文，編號為9954，上面的名字是“孫逸仙”，其中有幾張器官標本的照片。長久以來外界都一直以為孫中山死于肝癌，直至1999年海峽兩岸學者交流孫中山事跡時，協和醫院醫生展示了這份報告，才揭示了孫中山死于膽囊癌的真相。